保加利亚乳杆菌在发酵过程中，可以产生蛋白分解酶，在这种酶的作用下，大量的氨基酸从酪蛋白中游离出来，促进嗜热链球菌的发育。而嗜热链球菌产生的甲酸盐和二氧化碳可以促进保加利亚乳杆菌产酸。
这个过程，产生酸奶的“酸”和“稠”。
其他的乳酸菌为什么不能用于发酵酸奶？
以双歧杆菌为例。由于双歧杆菌比较脆弱、一点氧气都不能有，所以生长速度是非常慢的。正常发酵条件下，可能需要20个小时才能凝乳。同时，口感会非常不好，吃到嘴里可能会有刺鼻性的气味。
所以保加利亚乳杆菌和嗜热链球菌是优胜劣汰的结果，可以说是酸奶自己选择了它们。
养乐多和优益C里的菌种属于益生菌。
与保加利亚乳杆菌和嗜热链球菌不同，益生菌是有确切的临床试验数据证明，确系可以通过严酷的胃酸和胆盐环境，到达肠道并发挥益生作用的菌株。
而保加利亚乳杆菌和嗜热链球菌只在发酵酸奶时发挥作用，在肠道内是一过性的菌株，发挥不了益生作用。
可以说，养乐多之类乳酸菌饮料对于肠道保健方面更专业，里面益生菌的数量都会标注达到10^8及以上，而酸奶主要是补充牛奶里的营养，如蛋白质和脂肪。二者术业有专攻。
只是在市场条件的限制下，很难保证乳酸菌饮料的菌株活性、数量级到达肠道时能发挥作用，且里面有大量的糖，不推荐。
