其实两者在起源上毫无关联，只是凑巧使用了一样的颜色。
比利时的红黄黑来自于历史上统治过这片地区的几个公国/伯国的盾徽，而德国国旗的三色代表了“从束缚的黑暗（黑色）到血腥（红色）的战斗，再到金色（金色）的自由之光”这一过程。此外，黑红金三色旗在德国民主与专制的博弈进程中经历了数次存废，这样的历史进一步加强了这面旗“民主”与“共和”的属性。
先说比利时。
在奥地利统治期间（1714-1797），奥属尼德兰（即现在的比利时）曾尝试过多个版本的国旗，直到奥地利皇帝强制当地使用奥地利国旗。布鲁塞尔的市民反对这项措施，于是他们模仿了法国三色旗的样式，并用红、黄、黑三色填充了他们自己的三色旗。1830 年 8 月 26 日，布鲁塞尔歌剧院骚乱和比利时革命开始后的第二天，法国国旗在布鲁塞尔市政厅升起。 起义者匆忙用附近一家织物店生产的红色、黄色和黑色三色横条旗取代了法国国旗。 因此，比利时宪法第 193 条将比利时国家的颜色描述为红色、黄色和黑色，与官方旗帜中显示的顺序相反。 [1]
比利时国旗中的三色分别来自于神圣罗马帝国时期几个统治这片地区的公国/伯国的盾徽：
埃诺（Hainaut）伯国[2]、林堡（Limburg）公国[3]、卢森堡公国[4]的红狮子
布拉班特（Brabant）公国[5]的黄狮子
和弗兰德（Flanders）伯国[6]与那慕尔（Namur）伯国[7]的黑狮子
以上这几个地方共同组成了今日的比利时王国。
德国国旗“黑红金”三色旗的起源可以追溯到1813-1815年德意志解放战争时期吕措志愿军所穿的制服[8]：这个军团主要由反对法国占领德意志的学生组成，他们来自全德各地、所穿着的制服也五花八门。因此“制作制服的唯一方法是将不同颜色的制服染成黑色”。 还有金色（黄铜色）纽扣、红色袖口和袖扣。为了推广这套制服，“黑红金”三色也被称为“神圣罗马帝国的旧盔甲、旧颜色”（„Das ist das alte Reichspanier, Das sind die alten Farben!“）[9]
这三种颜色的组合也成为了德意志解放战争中的一句格言：
1813年6月17日，吕措志愿军在莱比锡附近的Kitzen中了法军的埋伏，几乎全军覆灭。
1815～1816年的维也纳会议后，松散的德意志邦联成立，其目的是团结在1806年神圣罗马帝国被废除后余下的德意志邦国，并以弗朗茨二世为其领袖。德意志邦联（1815–1866）期间，黑红金三色逐渐确立了其作为国家代表色的地位。
1815年6月12日，由七名本身为吕措志愿军成员、同时又是耶拿高级学生联合会军队成员的学生领头，同其他爱国学生一起建立了耶拿的Burschenschaft（学生社团，类似现今学生会，成立主旨是要消除当时大学里面，各德国邦联成员国学生各自成立组织，各自为政的分裂状况，而以学生社团做为共同的组织，成为当时校园里一种要求变革的学生运动，以“荣誉、自由、祖国”（Ehre, Freiheit, Vaterland）为口号，要求德意志统一、领邦立宪、新闻自由与一般民众参与政治的权利）。
这七个学生选择黑-红-金作为学生社团的旗帜颜色，其造型是三条等宽的的红-黑-红的横条组成的三色旗，有金色的流苏以及在黑色的横条中间有金色的橡树枝标志。
1817年10月18日，为了纪念德意志解放战争中为期四天的莱比锡战役，约500名来自德意志邦联各学生社团的学生和一些教授在“Nur im Ganzen ist Heil”（只有统一才是神圣）的口号下，高举黑-红-金旗帜（金色仅为流苏的颜色，旗杆为用黑色缎带环绕的橡树枝）集结于艾森纳赫附近的瓦尔特堡争取德国的民主统一（这一活动后来演变为今天的瓦尔特堡节）。
为了维持现状，奥地利帝国（德意志邦联的主席）于1819年通过了“卡尔司巴德决议”[12]。这份决议通过的四项法案包括：
后来直到1848年邦联议会解散，卡尔斯巴德决议才失效。
1832年5月27日到30日，大约三万民众参加了为进一步民主统一的汉巴赫节，他们第一次使用了真正意义上的黑红金三色旗，中间红色部分上题字到“Deutschlands Wiedergeburt”（德国重生），充分表示了参与者要求建立真正统一的民族国家的意愿，这面旗被称为Ur-Fahne（起源旗）。[13]
为了推翻君主制、建立共和制的德国，1848年爆发的革命开始使用黑红金三色旗，在此期间举行的国家议会将国旗的设计作为讨论主题之一。同年3月9日，于法兰克福最终决定开始官方使用黑红金三色旗。5月18日，第一次德意志国民大会在法兰克福圣保罗教堂举行。11月13日，帝国法律公报[14]宣布黑红金三色横条旗为德国国旗。
“黑白红”三色的构想最早由汉堡商会的秘书Adolf Soetbeers博士在1866年9月22日的不莱梅商业报纸的一篇文章中提出：理论上，当时德国所有的国际海上贸易是同时属于普鲁士和汉萨同盟的，所以这些商船都应该使用一个统一的既代表普鲁士（黑-白）又代表汉萨同盟（红-白）的标志。
德意志邦联中最有影响力的普鲁士，为了达到其控制整个德国的目的，于1867年建立了北德意志邦联。普鲁士王国首相奥托·冯·俾斯麦私下安排在于1867年7月1日的德国宪法中使用一种新的军旗和贸易旗：黑白红三色旗。
在官方解释中，“黑白”代表普鲁士，“红白”代表所有汉萨同盟的城市。普鲁士国王威廉一世也对这个颜色组合也非常满意，因为在他看来，“黑白”代表了普鲁士，而“红白”代表了勃兰登堡选帝侯。
黑白红三色旗的使用基本上没有得到反对，因为原本使用黑红金三色旗的首要目的也是德国的统一，而不是因为其颜色的缘故。取消掉金色也同时说明当时的德意志邦联不再包括奥地利帝国。
在普法战争后，其他南德邦国和北德意志邦联联合，于1871年完成了德意志统一，霍亨索伦王朝成为新的德意志帝国的统治者，黑白红三色旗最终于1892年成为德意志帝国的国旗，并被一直使用到1918年一战战败。
一战后成立的魏玛共和国采用了黑红金旗作为国旗，因为其代表了“德国的民主”。根据《魏玛宪法》，黑白红旗代表了君主独裁，因而必须进行修改（在旗帜左上角加一个小的黑红金旗）。后来出于妥协，魏玛政府于1922年重新采用黑白红旗作为外交用旗，而国防军军旗一直保留着黑白红旗。
1933年纳粹党夺权上台，开始对“卐字旗”进行一系列神化[16]。1935年9月15日，纳粹政府颁布的《帝国国旗法》规定“从这一天开始德国国旗只能是卐字旗（带左旋的卐字），不能再使用黑-白-红三色旗作为国旗”。
二次大战后，盟军管制理事会的通过的第一项法令即是永久废除纳粹的所有标志，禁止卐字旗出现在公共场所。这之后，德国急需一面新的国旗。
1948年3月，三个西方联盟英，美，法将其占领区合并并成立了德意志联邦共和国（即西德）。在准备西德新宪法的过程中，于1948年8月在海伦基姆湖宫举行的一次会议中“新的德国标志的制定”被提上了议程。虽然有人提议“在德国统一前不要制定新的德国国旗”，但由于1946年11月德国统一社会党的大力推荐，会议最终通过了“使用黑红金三色旗作为共和国国旗”的决议。
1946年起，苏占区开始考虑使用黑红金三色旗，并于1948年的第二次人民大会开始对是否启用黑红金三色旗作为东德国旗开展了讨论。根据弗里德里希·艾伯特的提议，1949年10月7日黑红金三色旗正式成为德意志民主共和国国旗。
在1949年到1959年期间，东德和西德的国旗理论上是完全相同的。
从1959年10月1日开始，东德政府在黑红金三色旗的中间加上了德意志民主共和国国徽。在西德方面看来，东德的这个举动是蓄意加深两德的分裂，因此在西德和西柏林这个旗帜被称为“分裂之旗”。
1989年11月柏林墙倒塌后，很多东德人效仿1956年匈牙利人的做法、去掉东德国旗上的国徽，转而倾向于使用单纯的黑红金三色旗为国旗。这也隐含了东西德同时希望恢复一个统一和民主的德国。
1990年10月3日，德国以德意志民主共和国并入德意志联邦共和国的方式完成了统一，黑红金三色旗成为了统一后的德国的国旗。
现在，旧的德意志帝国黑白红三色旗仍为一些君主主义者及一些希望能和平复辟的旧德国贵族所使用。不过这些使用者完全被遮盖在极右派的阴影之下，因为卐字旗在德国完全禁用，因此极右派也使用纳粹在1935年使用过的黑白红三色旗为自己的标志。
